组蛋白修饰检测
检测项目
组蛋白甲基化检测:
- 赖氨酸甲基化定量:甲基化水平(定量范围0-100%,参照ENISO17025)
- 精氨酸甲基化位点检测:修饰位点特异性(如H3R17me2,灵敏度≥95%)
- 动态甲基化分析:修饰变化速率(时间序列±10%波动)
- 乙酰化位点定量:乙酰化水平(检测限0.01ng/μl)
- 赖氨酸乙酰化验证:位点覆盖率(覆盖率≥99%,参照GB/T2828.1)
- 乙酰化动态变化:修饰波动阈值(±5%稳定性)
- 丝氨酸磷酸化检测:磷酸化位点丰度(定量精度±0.5%)
- 苏氨酸磷酸化验证:修饰特异性(特异性≥98%)
- 磷酸化动态分析:修饰响应时间(时间分辨率≤1min)
- 赖氨酸泛素化定量:泛素化水平(检测范围0.1-50μg/ml)
- 泛素链类型检测:链长分布(链长1-8ubiquitins)
- 泛素化动态变化:修饰降解速率(半衰期±10min)
- H3K27me3位点定量:丰度阈值(≥0.05%)
- H4K16ac位点验证:特异性(假阳性率≤1%)
- 位点共修饰分析:共发生频率(频率≥80%)
- 时间依赖性修饰波动:变化速率(斜率±0.1/hr)
- 环境响应修饰检测:响应阈值(刺激强度≥10单位)
- 修饰稳定性分析:半衰期(t1/2≥30min)
- H3.3变体修饰:修饰水平(定量精度±2%)
- H2A.Z变体分析:位点覆盖率(覆盖率≥95%)
- 变体动态变化:波动幅度(±15%范围)
- 修饰-蛋白质互作:结合亲和力(Kd≤10nM)
- 修饰-DNA结合检测:结合效率(效率≥90%)
- 互作动态监控:响应时间(≤5min)
- 质谱定量检测:离子强度(范围100-10000counts)
- 测序深度分析:覆盖深度(深度≥30x)
- 免疫沉淀定量:捕获效率(效率≥95%)
- 目标质谱检测:质量精度(精度≤5ppm)
- 非目标筛查:检测限(LOD≤0.001%)
- 定量重复性:变异系数(CV≤5%)
检测范围
1.癌细胞系样本:涵盖HeLa和MCF-7细胞系,重点检测H3K27me3修饰水平动态变化及甲基化异常。
2.干细胞样本:包括iPSC和胚胎干细胞,检测乙酰化修饰稳定性及分化相关修饰响应。
3.组织活检样本:涉及肝脏和肾脏组织切片,聚焦磷酸化修饰位点特异性及定量精度验证。
4.血液样本:涵盖全血和血清分离物,检测泛素化修饰水平及疾病标志物相关性。
5.冷冻组织切片:包含脑和心脏冷冻切片,重点分析修饰动态变化及保存稳定性。
6.固定细胞样本:如甲醛固定细胞,检测乙酰化修饰覆盖率及固定影响评估。
7.染色质免疫沉淀产物:ChIP产物样本,验证修饰位点特异性及互作效率。
8.Westernblot膜样本:蛋白质印迹膜,检测磷酸化修饰丰度及条带分辨率。
9.质谱样本制备物:纯化组蛋白提取物,聚焦质谱定量精度及离子强度范围。
10.基因编辑修饰样本:CRISPR编辑细胞,检测修饰靶向性及编辑效率验证。
检测方法
国际标准:
- ISO17025:2017实验室能力通用要求(样品处理温度差异:国际标准要求25±2°C,而国家标准为20±5°C)
- ENISO15189:2022医学实验室质量(检测灵敏度定义差异:国际标准灵敏度下限0.01%,国家标准为0.05%)
- ISO9001:2015质量管理体系(数据记录频率差异:国际标准每10min记录,国家标准每30min)
- GB/T2828.1-2012抽样检验程序(样品量差异:国家标准最小样本量100个,国际标准为50个)
- GB/T16886.1-2011医疗器械生物学评价(修饰定量方法差异:国家标准优先免疫法,国际标准优先质谱法)
- GB/T19001-2016质量管理体系(校准周期差异:国家标准每年校准,国际标准每半年)
检测设备
1.质谱仪:ThermoFisherOrbitrapFusionLumos(分辨率120,000)
2.下一代测序仪:IlluminaNovaSeq6000(通量20Tb/run)
3.共聚焦显微镜:ZeissLSM980(分辨率0.2μm)
4.实时PCR系统:QuantStudio7Flex(检测动态范围107)
5.Westernblot系统:Bio-RadChemiDocMP(灵敏度0.1pg)
6.染色质免疫沉淀套件:MilliporeMagnaChIPKit(捕获效率≥95%)
7.高速离心机:Eppendorf5424R(最大转速14,000rpm)
8.分光光度计:NanoDropOneC(检测波长190-840nm)
9.细胞培养箱:ThermoScientificHeracell150i(温度控制±0.5°C)
10.冷冻切片机:LeicaCM1950(切片厚度5-50μm)
11.蛋白质纯化系统:ÄKTApure25(流速范围0.01-25ml/min)
12.荧光检测器:PerkinElmerEnVision(检测限0.01RFU)
13.微量移液器:EppendorfResearchplus(精度±0.8%)
14.恒温振荡器:NewBrunswickInnova44(振荡频率30-300rpm)
15.电泳系统:Bio-RadMini-PROTEANTetra(电压范围10-300V)
北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。